Pokud se nemůže výtěr dopravit ještě ten samý den do laboratoře, lze jej uchovávat v transportní půdě 24 – 48 hod., při pokojové teplotě. Výtěr bez transportní půdy se musí zpracovat v den odběru. Obecně se výtěr bez transportní půdy nedoporučuje s ohledem na životnost některých náročnějších bakterií (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorhoeae, Shigella sp.…aj.). Výtěry se uchovávají při pokojové teplotě. Odběr se provádí před započetím léčby, v průběhu léčby se kontrolní odběry provádí při zhoršení stavu pacienta, nebo pokud se klinický stav nelepší i přes léčbu vhodnými antibiotiky. Pro speciální vyšetření na Vibrio cholerae, Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis je nutná domluva s laboratoří předem.